Во-первых, у него двугранный стебель, который очень редок среди растений; травы имеют, как правило, округлый или четырехгранный стебель.

Bo-вторыx, если смотреть на молодые листья против света, то на них видны светлые маленькие точки, будто растение продырявлено. Это места желез со светлым секретом — смесь эфирного масла и смолы.

В-третьих, желтые цветки, если их потереть между пальцами, изменяют окраску на кровавокрасную. Цветет с июля по сентябрь. 

• 20 г цветков зверобоя продырявленного (свежих) залить 200 мл оливкового масла и настаивать в течение 40 дней. Принимать по 1-2 чайные ложки за 30 минут до еды 2-3 раза в день при язвенной болезни и при стоматитах, пародонтозе, фарингитах, а также при заболеваниях желчных протоков и при почечно-каменной болезни как болеутоляющее и глистогонное средство.
• Полстакана свежих цветов и листьев зверобоя (измельченных) настоять на стакане миндального, подсолнечного, оливкового или льняного масла в течение трех недель. Отжать, процедить. Хранить в прохладном месте.
• Применяется зверобойное масло при ожогах (радикальное средство), даже если поражено 2/3 поверхности тела. На пораженные места делаются масляные компрессы при долго незаживающих ранах, язвах, нарывах, гнойниках, воспалениях, разрыхлениях слизистой оболочки рта, смазывают раны, полученные от укуса здоровой собаки или кошки, высыпании на губах после простуды.